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readme.md

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+# 高通量筛选
+
+## 配置需求
+
+需要两个conda环境，名字分别为**screen**,**zeo**
+
+### zeo
+
+#### 运行库需求
+
+``` 2018.12.12
+python == 2
+pymatgen == 2018.12.12
+Numpy = 1.16.6
+os
+argparse = 1.4.0
+PrettyTable = 1.01
+monty = 1.0.0
+future = 1.0.0
+```
+
+#### zeo++软件需求
+
+需要编译后放入python库中
+
+### screen
+
+```
+python == 3.11.4
+pymatgen == 2024.11.13
+```
+
+## 使用说明
+
+如果配置的conda环境同名，运行**main.sh**即可
+
+当数据来源为MP时，需要将数据放在input_pre中
+
+如果数据来源为ICSD，仅需将数据放在input中即可
+
+
+
+# 扩胞
+## 以下为每一步的分解
+### Step1
+读取cif文件
+### Step2
+统计Occupation情况，将具有相同Occupation值的记为一类，用Occupation值作为Key创建字典，该字典的一个项为atom_serial,是一个列表，记录相同Ocupation值的原子序号
+将上述字典输入一个列表Occupation_list，字典预留分子与分母两个参数
+需要函数为
+```angular2html
+def process_cif_file(struct)
+    return Occupation_list 
+```
+### step3
+根据Occupation_list来计算扩大倍数\\
+首先逐一计算每个字典的分子与分母，根据key来计算，例如第一个key值为0.5,此时其对应分子为1，分母为2
+合并没一个字典，探索每一个分数的情况并求出公约数与对应的分子，更新每一个字典的值
+### step4
+根据分子与分母情况，生成structure_list，其中Occupation_list中的元素的number处的和为分子，总共个数为分母
+### step5
+根据材料结构决定对称性，对不同对称性得到不同等效情况
+根据对称性与最终扩胞生成三个方向扩胞列表，其中每个元素是字典，遵循格式为{["x":1,"y":2,"z":1]}
+### step5
+根据structure_list与Occupation_list生成新的cif并保存
+### 一些假设
+只考虑两个原子在同一位置上，暂不考虑三个原子以上的情况
+不考虑Li原子的共占位情况，对Li原子不做处理